Certains programmes de la FMSH concernent l'ensemble des sciences sociales et appellent à la participation de chercheurs quelle que soit leur nationalité.
Il en est ainsi du programme international d'études avancées (PIEA) qui offre à tous les chercheurs la possibilité de travailler ensemble au sein de petits groupes internationaux se réunissant pour des durées de trois à quatre mois.
De même, dans le cadre de l’aide à la mobilité, le programme de directeurs d'études associés (DEA) est ouvert à toutes les nationalités.
Trois programmes originaux par leur contenu trouvent par ailleurs ici leur place :