Outre les centres hébergés avec lesquels elle est en contact direct, la Fondation Maison des sciences de l'homme, en tant que plate-forme de collaborations scientifiques, a constitué un réseau de partenaires, en France et à l'étranger (grandes institutions de recherche françaises et étrangères, fondations internationales, organismes financiers et entreprises technologiques).
La FMSH est membre du Réseau des MSH.
Partenaires publics et institutionnels français
- Ecole des hautes études en sciences sociales (EHESS)
- Centre national de la recherche scientifique (CNRS)
- Institut d'études politiques de Paris (Science Po)
- Ecole pratique des hautes études
- Universités françaises
- Ville de Paris
Partenaires scientifiques étrangers
- Académie des sciences de Russie
- Académie des sciences de Chine
- Académie des sciences du Mexique
- Conseil Indien de la recherche en sciences sociales
- Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG)
- Deutscher Akademischer Austauschdienst (DAAD)
- British Academy
- Goethe-Institut
Fondations
- Andrew W. Mellon Foundation
- Ford Foundation
- Fritz Thyssen Stiftung (Köln)
- Fondation Robert Bosch (Stuttgart)
- Stiftung Vokswagen (Hannover)
- Robert Bosch Stiftung (Stuttgart)
- DVA Stiftung (Stuttgart)
Organismes financiers
- Banco do Brasil
Entreprises technologiques
- EDF R&D
- Microsoft





